临床科室：

普外一科、胸外科、普外二科、乳腺外科（市重点专科）、骨一科（脊柱外科）、骨二科（关节外科）、痔瘘医院（市重点专科）、神经内一科、神经内二科、神经内三科、心血管内一科（市重点专科）、心血管内二科（老年病科）（市重点专科）、麻醉与围术期医学科、重症医学科、泌尿外科、呼吸与危重症医学科、肾病内分泌科、消化内科（市重点专科）、新生儿科、儿内科、妇产科、眼科、急诊科、神经外科、肿瘤科、耳鼻喉科、监管病区；口腔科、烧伤整形显微外科、医学美容科、针灸理疗康复科、风湿内分泌科、中医科、血液净化中心。

医技科室：

药剂科、检验科、放疗中心、CT室、核磁共振室、超声科、放射科、输血科、病理科、胃镜室、支气管镜室、高压氧治疗中心、介入室、心电图室、脑电、经颅室。

行政后勤职能科室：

院办公室、党委办公室、人事科、财务科、宣传科、医务部、科教科、医技部、护理部、感染管理科、预防保健科、外联部、社工部、患者服务中心、离退休干部保健管理办、质控科、健康管理中心、营养科、病案室、统计科、车队、信息中心、工会、医疗保障科、经管科、物价科、审计科、收费室、设备管理科、制氧中心、保卫科、采供科、总务科、基建办。